Les cyanobactéries sont présentes naturellement dans le lac du Bourget. Elles jouent un rôle essentiel dans son fonctionnement.
Cependant, lorsque le milieu est déséquilibré, elles peuvent se développer de manière excessive et produire des toxines dangereuses pour les animaux.

Actuellement, le taux de cyanobactéries est inférieur au seuil d’alerte, ce qui permet la réouverture de la baignade. Toutefois, il peut augmenter au cours de l’été. Il est donc recommandé de ne pas avaler l’eau du lac et d’empêcher les chiens de boire dans les zones où l’eau est stagnante ou avec une teinte verte.